MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmI

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017557	AAC	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017557	TAAC	2	8	37	44	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017557	AAC	2	6	709	714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017557	GCC	2	6	778	783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017557	CCG	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017557	GCCG	2	8	810	817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017557	GGC	2	6	837	842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017557	CGGT	2	8	859	866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017557	GAAC	2	8	917	924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017557	GCG	2	6	929	934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017557	T	6	6	1024	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017557	AAGG	2	8	1092	1099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017557	CTT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017557	CATC	2	8	1190	1197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017557	TGG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017557	G	6	6	1287	1292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017557	GAC	2	6	1637	1642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017557	GAG	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017557	GCCA	2	8	1741	1748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017557	GCC	2	6	1814	1819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017557	GTG	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017557	TCC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017557	CCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017557	TTG	2	6	2998	3003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017557	T	6	6	3016	3021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017557	ATTT	2	8	3090	3097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017557	GCA	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017557	CGT	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017557	CTC	2	6	3284	3289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017557	GAC	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017557	TGC	3	9	3393	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017557	GGT	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017557	A	6	6	7919	7924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017557	CGG	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017557	GCCA	2	8	8033	8040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017557	TCA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017557	TTG	2	6	8189	8194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017557	GCG	2	6	8195	8200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017557	G	7	7	8200	8206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017557	TAC	2	6	8273	8278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017557	TCCGT	2	10	8313	8322	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017557	CCG	2	6	8978	8983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017557	CGGC	2	8	12892	12899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017557	CGGC	2	8	12916	12923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017557	GGT	2	6	12963	12968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017557	CAGC	2	8	12991	12998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017557	CAC	2	6	13004	13009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017557	AC	4	8	13008	13015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017557	TCACGT	2	12	13027	13038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017557	ATCT	2	8	13049	13056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017557	CCT	2	6	14265	14270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017557	GT	5	10	14280	14289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017557	CGT	2	6	14304	14309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017557	GGC	2	6	14356	14361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017557	GCC	2	6	14369	14374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017557	CCAT	2	8	14391	14398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017557	CGG	2	6	14408	14413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017557	GC	3	6	14418	14423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017557	GC	3	6	14437	14442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017557	GC	3	6	14449	14454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017557	GCG	2	6	14463	14468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017557	T	6	6	14516	14521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017557	CTCA	2	8	18489	18496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017557	A	6	6	18496	18501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017557	TTTC	2	8	18534	18541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017557	TGT	2	6	18575	18580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017557	GAT	2	6	18651	18656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017557	CGT	2	6	18660	18665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017557	AGTTCG	2	12	18673	18684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017557	GCG	2	6	18717	18722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017557	ATT	2	6	18772	18777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017557	GTC	2	6	19630	19635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017557	ATG	2	6	19656	19661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017557	TAAT	2	8	20463	20470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017557	CAA	2	6	20522	20527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017557	CGT	2	6	20546	20551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017557	ACA	2	6	20560	20565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017557	GGAT	2	8	20570	20577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017557	CCTGG	2	10	20655	20664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017557	GAA	2	6	20693	20698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017557	AGGA	2	8	20713	20720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017557	GAA	2	6	20751	20756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017557	GCC	2	6	20763	20768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017557	GC	3	6	20772	20777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017557	G	8	8	21010	21017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017557	CCG	2	6	21238	21243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017557	TC	3	6	22151	22156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017557	CCCTC	3	15	22171	22185	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_017557	CGC	2	6	22216	22221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017557	CAT	2	6	22270	22275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017557	CAG	2	6	22332	22337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017557	GCC	2	6	22499	22504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017557	CGG	3	9	22507	22515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017557	AAG	2	6	22525	22530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017557	CTGA	2	8	22570	22577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017557	TGA	2	6	23269	23274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017557	TGGC	2	8	23275	23282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017557	GCCAG	2	10	23315	23324	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017557	CGAC	2	8	23348	23355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017557	CTT	2	6	23365	23370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017557	GCC	2	6	23410	23415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017557	TTG	2	6	23468	23473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017557	CGT	2	6	23501	23506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017557	TTA	2	6	23527	23532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017557	GCC	2	6	23553	23558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017557	GTG	2	6	24003	24008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017557	CCA	2	6	24028	24033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017557	ACG	2	6	24038	24043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017557	CCAC	2	8	24050	24057	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_017557	TTA	2	6	24092	24097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017557	GTA	4	12	24120	24131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017557	ACA	2	6	24143	24148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017557	GTG	2	6	24802	24807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017557	TTA	2	6	24811	24816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017557	TTA	2	6	24832	24837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.